134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54396 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_54396  fasciclin domain-containing protein  100 
 
 		 487 aa  972    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54395  fasciclin domain-containing protein  33.02 
 
 		 437 aa  136  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.190413  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  34.23 
 
 		 164 aa  78.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  34.23 
 
 		 167 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.67 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  29.39 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  29.93 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  28.9 
 
 		 611 aa  71.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.9 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.82 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  29.73 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 		 558 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  32 
 
 		 195 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  27.14 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  35.95 
 
 		 142 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  33.83 
 
 		 194 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  34.81 
 
 		 596 aa  64.7  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  35 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  30.63 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  37.96 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  32.69 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  31.01 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  32.69 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  30.77 
 
 		 191 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  31.43 
 
 		 166 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  30.66 
 
 		 279 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  29.75 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  36.5 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  31.68 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  31.21 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  30.15 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.94 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  32.85 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4432  beta-Ig-H3/fasciclin  26.72 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.370103  normal  0.663169 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  36.36 
 
 		 162 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  35 
 
 		 178 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  31.37 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  29.93 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2962  secreted and surface protein  26.45 
 
 		 140 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154745  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  28.19 
 
 		 166 aa  57  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  31.33 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  28.03 
 
 		 191 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  34.15 
 
 		 168 aa  56.6  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  27.59 
 
 		 183 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.21 
 
 		 139 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  31.17 
 
 		 189 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  33.06 
 
 		 194 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  29.11 
 
 		 192 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  32.72 
 
 		 187 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  29.79 
 
 		 187 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  30.5 
 
 		 187 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  32.64 
 
 		 169 aa  55.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  27.52 
 
 		 238 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2197  beta-Ig-H3/fasciclin  29.05 
 
 		 346 aa  54.7  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  29.93 
 
 		 222 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  31.51 
 
 		 215 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  28.77 
 
 		 231 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  30.19 
 
 		 212 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  32.12 
 
 		 163 aa  53.5  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  32.92 
 
 		 190 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  32.92 
 
 		 190 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0078  beta-Ig-H3/fasciclin  35.83 
 
 		 214 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  30.97 
 
 		 202 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  28.03 
 
 		 157 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  31.21 
 
 		 186 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4788  beta-Ig-H3/fasciclin  30.77 
 
 		 222 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  31.03 
 
 		 216 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  26.76 
 
 		 140 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  31.62 
 
 		 133 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  31.62 
 
 		 133 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  29.05 
 
 		 160 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1724  beta-Ig-H3/fasciclin  28.06 
 
 		 143 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  29.41 
 
 		 208 aa  52.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  31.43 
 
 		 160 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  30.53 
 
 		 161 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  31.03 
 
 		 157 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  27.27 
 
 		 184 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  29.11 
 
 		 202 aa  51.6  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  30.25 
 
 		 183 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  30.37 
 
 		 151 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  28.76 
 
 		 225 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  29.14 
 
 		 193 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12888  cell surface lipoprotein mpt83 (lipoprotein P23)  28.48 
 
 		 220 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  24.65 
 
 		 510 aa  50.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  32.85 
 
 		 143 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  28.31 
 
 		 193 aa  50.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  30.95 
 
 		 215 aa  50.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3760  beta-Ig-H3/fasciclin  36.67 
 
 		 227 aa  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.812819  normal  0.0116816 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01730  hypothetical protein  24.42 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  29.93 
 
 		 184 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  25.98 
 
 		 217 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  29.58 
 
 		 157 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  29.25 
 
 		 139 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2200  beta-Ig-H3/fasciclin  26.97 
 
 		 141 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.474723  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  28.46 
 
 		 160 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  30.77 
 
 		 185 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  26.97 
 
 		 200 aa  48.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  29.81 
 
 		 194 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  30.6 
 
 		 134 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  29.81 
 
 		 194 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>