89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1665 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  79.27 
 
 		 174 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  37.61 
 
 		 358 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  30.99 
 
 		 456 aa  74.7  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  40.79 
 
 		 239 aa  74.3  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  43.42 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  38.96 
 
 		 114 aa  72  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  42.86 
 
 		 72 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  41.25 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  38.16 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  37.35 
 
 		 539 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  42.17 
 
 		 623 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  38.96 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  39.47 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  38.16 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 		 318 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  33.77 
 
 		 444 aa  61.2  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  30.68 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  30.68 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  39.47 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  31.17 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  34.78 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  32.89 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  34.29 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  30.68 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  32.71 
 
 		 336 aa  57.4  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  38.16 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  32.89 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  31.58 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  32.5 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  30.12 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0973  hypothetical protein  45.31 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.149574 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  38.24 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  31.88 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  33.02 
 
 		 280 aa  54.7  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  39.71 
 
 		 334 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 454 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  34.78 
 
 		 112 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0340  blue (type1) copper domain-containing protein  34.26 
 
 		 130 aa  52  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 		 97 aa  50.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  34.15 
 
 		 301 aa  50.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  37.31 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  29.11 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.89 
 
 		 417 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  37.31 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  37.31 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  35.29 
 
 		 264 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  33.33 
 
 		 107 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  33.66 
 
 		 121 aa  48.5  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0030  hypothetical protein  41.46 
 
 		 334 aa  48.5  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3552  blue (type 1) copper domain protein  28.99 
 
 		 119 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  30 
 
 		 119 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  32.89 
 
 		 124 aa  47.8  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  31.58 
 
 		 192 aa  47.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1921  blue (type1) copper domain-containing protein  35 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  30.38 
 
 		 270 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 		 749 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  32.39 
 
 		 119 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  31.58 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1647  hypothetical protein  40.74 
 
 		 531 aa  45.1  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0333  hypothetical protein  45.24 
 
 		 1042 aa  45.1  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0875  phosphonate ABC transporter periplasmic phosphonate-binding protein  38.98 
 
 		 362 aa  45.1  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122737 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  35.82 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  32 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  31.76 
 
 		 127 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3140  hypothetical protein  26.67 
 
 		 458 aa  44.3  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1542  blue (type1) copper domain-containing protein  34.85 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 771 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  29.87 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  34.02 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4791  putative amicyanin protein  29.27 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0921378 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  34.57 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4880  putative amicyanin protein  28.74 
 
 		 106 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.266193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1636  hypothetical protein  43.59 
 
 		 517 aa  42.4  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  31.71 
 
 		 192 aa  42  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1638  hypothetical protein  30 
 
 		 623 aa  42  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6437  hypothetical protein  32.89 
 
 		 107 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  28.57 
 
 		 119 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0467  hypothetical protein  32.2 
 
 		 473 aa  42  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0035824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  28.95 
 
 		 117 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  31.88 
 
 		 287 aa  42  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0986  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 479 aa  41.2  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.461111 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1087  hypothetical protein  38.3 
 
 		 518 aa  41.2  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  24.66 
 
 		 257 aa  41.2  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  35.06 
 
 		 347 aa  40.8  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  31.17 
 
 		 104 aa  40.8  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>