64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0925 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 
121 aa  248  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1921  blue (type1) copper domain-containing protein  68.1 
 
 
126 aa  152  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  35.54 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  40.48 
 
 
264 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  42.7 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  41.57 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  40.24 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  42.47 
 
 
72 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  35.45 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  35.65 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  37.62 
 
 
179 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  38.64 
 
 
109 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  39.76 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  40.74 
 
 
358 aa  55.1  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  31.4 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  31.4 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  31.45 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  36.14 
 
 
110 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  39.19 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  31.4 
 
 
112 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1734  hypothetical protein  31.09 
 
 
276 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0063943  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  33.73 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  32.1 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  44.12 
 
 
301 aa  50.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  37.66 
 
 
444 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  36.67 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  30.85 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  32.14 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  34.57 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  33.66 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  42.37 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  27.12 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  27.12 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  36.14 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  29.27 
 
 
131 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  37.5 
 
 
124 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  35.37 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  29.79 
 
 
486 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1566  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.12 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0060  hypothetical protein  30.12 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1216  hypothetical protein  30.12 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1499  hypothetical protein  30.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0088  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.12 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0072  hypothetical protein  30.12 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  35.71 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0071  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.12 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  35.06 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  29.06 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  36.49 
 
 
623 aa  44.7  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  30 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.71 
 
 
749 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  32.18 
 
 
336 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0200  hypothetical protein  29.7 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  29.76 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0215  putative amicyanin precursor protein  29.21 
 
 
113 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  38.46 
 
 
539 aa  41.6  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  25.87 
 
 
146 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  29.09 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  34.57 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  38.67 
 
 
239 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1071  hypothetical protein  26.95 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  30.59 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>