45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1456 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  679    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0467  hypothetical protein  52.53 
 
 
473 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0035824 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0973  hypothetical protein  46.15 
 
 
299 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.149574 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1648  hypothetical protein  54.74 
 
 
572 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  50.94 
 
 
623 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1087  hypothetical protein  48.96 
 
 
518 aa  107  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0408  secreted protein  50.94 
 
 
160 aa  102  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121912 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1636  hypothetical protein  52.87 
 
 
517 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0333  hypothetical protein  44.44 
 
 
1042 aa  92.8  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1638  hypothetical protein  43.82 
 
 
623 aa  89.7  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0986  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 
479 aa  87  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.461111 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1647  hypothetical protein  46.51 
 
 
531 aa  86.3  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0030  hypothetical protein  32.21 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4076  putative secreted protein  41.82 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.215347 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1644  hypothetical protein  38.95 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  41.11 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3736  hypothetical protein  37.7 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4975  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4264  hypothetical protein  37.38 
 
 
178 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238276  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2510  Electron transfer DM13  38.71 
 
 
162 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0416881 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5513  secreted protein  32.71 
 
 
167 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.390859 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1199  hypothetical protein  34.55 
 
 
216 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3316  Electron transfer DM13  39.22 
 
 
191 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.83711  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3791  hypothetical protein  34.65 
 
 
204 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179686  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1961  hypothetical protein  32.41 
 
 
157 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1934  hypothetical protein  32.41 
 
 
157 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0875  phosphonate ABC transporter periplasmic phosphonate-binding protein  48.21 
 
 
362 aa  60.1  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122737 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0394  electron transfer DM13  30.3 
 
 
151 aa  59.7  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4662  hypothetical protein  29.36 
 
 
228 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3238  hypothetical protein  30 
 
 
198 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1639  hypothetical protein  29.52 
 
 
443 aa  57  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4171  hypothetical protein  36.21 
 
 
227 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0479  phosphate ABC transporter periplasmic phosphate-binding protein  51.35 
 
 
417 aa  55.8  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.719284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2225  hypothetical protein  26.9 
 
 
208 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  39.71 
 
 
167 aa  52.8  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0367  putative lipoprotein  30.48 
 
 
145 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0316  hypothetical protein  32.18 
 
 
178 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.961857  normal  0.636022 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1255  hypothetical protein  35.23 
 
 
219 aa  51.2  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  38.46 
 
 
174 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0732  hypothetical protein  32.35 
 
 
146 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0748  hypothetical protein  32.35 
 
 
146 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.5991  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2014  Electron transfer DM13  31.62 
 
 
155 aa  46.2  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0122  hypothetical protein  29.41 
 
 
192 aa  46.2  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151218  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4340  hypothetical protein  26.43 
 
 
158 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1958  hypothetical protein  29.17 
 
 
162 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0107464  normal  0.0222962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>