26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0408 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0408  secreted protein  100 
 
 		 160 aa  328  3e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121912 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  50 
 
 		 334 aa  104  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5513  secreted protein  36.08 
 
 		 167 aa  101  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.390859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4264  hypothetical protein  37.13 
 
 		 178 aa  100  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1199  hypothetical protein  45.05 
 
 		 216 aa  93.2  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0122  hypothetical protein  32.39 
 
 		 192 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3238  hypothetical protein  34.36 
 
 		 198 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3316  Electron transfer DM13  32.53 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.83711  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4662  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2510  Electron transfer DM13  38.41 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0416881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3791  hypothetical protein  38.83 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4171  hypothetical protein  39.81 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4076  putative secreted protein  36.15 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.215347 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3736  hypothetical protein  31.1 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0367  putative lipoprotein  32.91 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4975  hypothetical protein  32 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1934  hypothetical protein  33.96 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1961  hypothetical protein  33.96 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2225  hypothetical protein  31.78 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0748  hypothetical protein  27.22 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.5991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0732  hypothetical protein  27.22 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0316  hypothetical protein  28.86 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.961857  normal  0.636022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2014  Electron transfer DM13  31.08 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0394  electron transfer DM13  26.53 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4340  hypothetical protein  35.35 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4776  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0192522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>