35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3791 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3791  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  408  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179686  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4171  hypothetical protein  74.45 
 
 
227 aa  320  8e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4264  hypothetical protein  49.75 
 
 
178 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238276  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0122  hypothetical protein  47.98 
 
 
192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151218  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3316  Electron transfer DM13  41.85 
 
 
191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.83711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3238  hypothetical protein  41.3 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1199  hypothetical protein  41.38 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5513  secreted protein  36.99 
 
 
167 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.390859 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0408  secreted protein  38.83 
 
 
160 aa  77  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4662  hypothetical protein  31.21 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4076  putative secreted protein  35.4 
 
 
142 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.215347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0316  hypothetical protein  34.87 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.961857  normal  0.636022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3736  hypothetical protein  35.71 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4975  hypothetical protein  33.63 
 
 
144 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1961  hypothetical protein  36.44 
 
 
157 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1934  hypothetical protein  36.44 
 
 
157 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  34.65 
 
 
334 aa  61.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2510  Electron transfer DM13  29.05 
 
 
162 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0416881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2225  hypothetical protein  34.19 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0394  electron transfer DM13  27.66 
 
 
151 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0367  putative lipoprotein  30.61 
 
 
145 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4340  hypothetical protein  27.27 
 
 
158 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0748  hypothetical protein  30.59 
 
 
146 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.5991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0732  hypothetical protein  30.59 
 
 
146 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4124  hypothetical protein  35.21 
 
 
158 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3776  hypothetical protein  35.21 
 
 
158 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0031  hypothetical protein  35.21 
 
 
158 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1231  hypothetical protein  35.56 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538059  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1649  hypothetical protein  35.56 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1738  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  35.56 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0355  hypothetical protein  35.56 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0064  hypothetical protein  35.56 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.64841  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0229  hypothetical protein  35.56 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1071  hypothetical protein  35.56 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1180  hypothetical protein  34.44 
 
 
156 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>