33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4171 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4171  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3791  hypothetical protein  73.89 
 
 		 204 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0122  hypothetical protein  44.14 
 
 		 192 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4264  hypothetical protein  43.84 
 
 		 178 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3316  Electron transfer DM13  36.54 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.83711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3238  hypothetical protein  36.73 
 
 		 198 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1199  hypothetical protein  50.88 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5513  secreted protein  44.64 
 
 		 167 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.390859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4662  hypothetical protein  30 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0408  secreted protein  39.81 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3736  hypothetical protein  35.88 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4076  putative secreted protein  37.17 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.215347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0316  hypothetical protein  35.9 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.961857  normal  0.636022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1934  hypothetical protein  36.52 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1961  hypothetical protein  36.52 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4975  hypothetical protein  32.74 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2225  hypothetical protein  34.48 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  34.11 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2510  Electron transfer DM13  31.34 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0416881 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1198 aa  55.1  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0394  electron transfer DM13  28.37 
 
 		 151 aa  52.4  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4281  cell surface protein  31.82 
 
 		 953 aa  52  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.533345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1362  hypothetical protein  42.62 
 
 		 321 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00460069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4674  cell surface protein  32.31 
 
 		 939 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0699989  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0367  putative lipoprotein  31.63 
 
 		 145 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26 
 
 		 2449 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4661  cell surface protein  34 
 
 		 907 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0748  hypothetical protein  30.59 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.5991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0732  hypothetical protein  30.59 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0031  hypothetical protein  32.39 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.18 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3776  hypothetical protein  32.39 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4124  hypothetical protein  32.39 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>