23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3238 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3238  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  390  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1199  hypothetical protein  53.41 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0122  hypothetical protein  44.22 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4264  hypothetical protein  38.54 
 
 		 178 aa  131  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4171  hypothetical protein  34.38 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3791  hypothetical protein  39.15 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5513  secreted protein  33.16 
 
 		 167 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.390859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3316  Electron transfer DM13  32.79 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.83711  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3736  hypothetical protein  42.15 
 
 		 167 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0408  secreted protein  32.07 
 
 		 160 aa  85.9  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0316  hypothetical protein  33.97 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.961857  normal  0.636022 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4076  putative secreted protein  36.92 
 
 		 142 aa  77.8  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.215347 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1961  hypothetical protein  34.81 
 
 		 157 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1934  hypothetical protein  34.81 
 
 		 157 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4662  hypothetical protein  34.82 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2225  hypothetical protein  36.76 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4975  hypothetical protein  32.38 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0394  electron transfer DM13  28.18 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  30 
 
 		 334 aa  58.5  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2510  Electron transfer DM13  27.34 
 
 		 162 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0416881 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0748  hypothetical protein  25.18 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.5991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0732  hypothetical protein  25.18 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2014  Electron transfer DM13  32.26 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>