23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3316 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3316  Electron transfer DM13  100 
 
 
191 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.83711  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4264  hypothetical protein  46.02 
 
 
178 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238276  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0122  hypothetical protein  46.15 
 
 
192 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151218  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3791  hypothetical protein  41.85 
 
 
204 aa  138  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179686  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4171  hypothetical protein  36.54 
 
 
227 aa  124  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5513  secreted protein  32.56 
 
 
167 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.390859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3238  hypothetical protein  32.56 
 
 
198 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1199  hypothetical protein  42.98 
 
 
216 aa  93.6  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0408  secreted protein  31.93 
 
 
160 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4662  hypothetical protein  32.48 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0316  hypothetical protein  40 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.961857  normal  0.636022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2510  Electron transfer DM13  33.33 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0416881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4975  hypothetical protein  31.48 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4076  putative secreted protein  29.69 
 
 
142 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.215347 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  39.22 
 
 
334 aa  62  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1934  hypothetical protein  29.73 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1961  hypothetical protein  29.73 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2225  hypothetical protein  26.9 
 
 
208 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3736  hypothetical protein  28.81 
 
 
167 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0394  electron transfer DM13  28.57 
 
 
151 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0367  putative lipoprotein  27.38 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0748  hypothetical protein  26.19 
 
 
146 aa  42  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.5991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0732  hypothetical protein  26.19 
 
 
146 aa  42  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>