34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4264 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4264  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  359  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238276  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3791  hypothetical protein  49.75 
 
 
204 aa  189  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179686  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0122  hypothetical protein  50.55 
 
 
192 aa  180  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151218  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4171  hypothetical protein  43.84 
 
 
227 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3316  Electron transfer DM13  46.2 
 
 
191 aa  153  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.83711  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5513  secreted protein  39.88 
 
 
167 aa  120  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.390859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3238  hypothetical protein  38.82 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1199  hypothetical protein  38.42 
 
 
216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0408  secreted protein  38.32 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3736  hypothetical protein  39.45 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4076  putative secreted protein  35.14 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.215347 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1961  hypothetical protein  29.63 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1934  hypothetical protein  29.63 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4975  hypothetical protein  32.08 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4662  hypothetical protein  28.67 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0316  hypothetical protein  34.21 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.961857  normal  0.636022 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  37.38 
 
 
334 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2225  hypothetical protein  33.93 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2510  Electron transfer DM13  33.64 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0416881 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1071  hypothetical protein  36.73 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1231  hypothetical protein  36.73 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538059  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1649  hypothetical protein  36.73 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1738  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  36.73 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0355  hypothetical protein  36.73 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0064  hypothetical protein  36.73 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.64841  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0229  hypothetical protein  36.73 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1180  hypothetical protein  35.71 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0394  electron transfer DM13  29.63 
 
 
151 aa  53.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3776  hypothetical protein  29.24 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4124  hypothetical protein  29.24 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0031  hypothetical protein  29.24 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4340  hypothetical protein  32.43 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2454  hypothetical protein  35 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0367  putative lipoprotein  25.5 
 
 
145 aa  41.6  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>