20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1199 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1199  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3238  hypothetical protein  56.35 
 
 
198 aa  178  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0122  hypothetical protein  46.83 
 
 
192 aa  161  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151218  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4171  hypothetical protein  42.11 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4264  hypothetical protein  39.09 
 
 
178 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238276  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3791  hypothetical protein  43.01 
 
 
204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179686  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5513  secreted protein  37.37 
 
 
167 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.390859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3316  Electron transfer DM13  38.02 
 
 
191 aa  118  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.83711  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0408  secreted protein  36.22 
 
 
160 aa  101  8e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4662  hypothetical protein  38.92 
 
 
228 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0316  hypothetical protein  41.03 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.961857  normal  0.636022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3736  hypothetical protein  40.37 
 
 
167 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2225  hypothetical protein  36.62 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4975  hypothetical protein  37.27 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1934  hypothetical protein  39.02 
 
 
157 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1961  hypothetical protein  39.02 
 
 
157 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4076  putative secreted protein  34.96 
 
 
142 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.215347 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  34.55 
 
 
334 aa  64.3  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2510  Electron transfer DM13  33.33 
 
 
162 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0416881 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0394  electron transfer DM13  29.27 
 
 
151 aa  55.1  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>