28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0122 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0122  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  383  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151218  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3791  hypothetical protein  47.98 
 
 
204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179686  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4264  hypothetical protein  50.55 
 
 
178 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238276  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4171  hypothetical protein  44.14 
 
 
227 aa  180  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3316  Electron transfer DM13  46.29 
 
 
191 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.83711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3238  hypothetical protein  45.35 
 
 
198 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1199  hypothetical protein  48.02 
 
 
216 aa  131  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5513  secreted protein  33.91 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.390859 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0408  secreted protein  32.39 
 
 
160 aa  92.8  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0316  hypothetical protein  34.96 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.961857  normal  0.636022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4662  hypothetical protein  31.93 
 
 
228 aa  71.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2510  Electron transfer DM13  31.07 
 
 
162 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0416881 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1961  hypothetical protein  28.68 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1934  hypothetical protein  28.68 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4975  hypothetical protein  30 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4076  putative secreted protein  29.93 
 
 
142 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.215347 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3736  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2225  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0394  electron transfer DM13  24.11 
 
 
151 aa  48.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3776  hypothetical protein  31 
 
 
158 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0031  hypothetical protein  31 
 
 
158 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4124  hypothetical protein  31 
 
 
158 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  29.41 
 
 
334 aa  46.2  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4340  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0229  hypothetical protein  32.37 
 
 
156 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0748  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  41.2  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.5991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0732  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  41.2  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1180  hypothetical protein  30.94 
 
 
156 aa  41.2  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>