23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2510 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2510  Electron transfer DM13  100 
 
 		 162 aa  330  6e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0416881 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0408  secreted protein  42.72 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121912 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3316  Electron transfer DM13  33.33 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.83711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0122  hypothetical protein  31.07 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  38.71 
 
 		 334 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4264  hypothetical protein  33.64 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5513  secreted protein  33.04 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.390859 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1199  hypothetical protein  33.94 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3791  hypothetical protein  29.05 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4171  hypothetical protein  30.97 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1934  hypothetical protein  33.87 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1961  hypothetical protein  33.87 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4076  putative secreted protein  33.58 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.215347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3238  hypothetical protein  27.34 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4975  hypothetical protein  33.96 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0316  hypothetical protein  29.71 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.961857  normal  0.636022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3736  hypothetical protein  37.84 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0031  hypothetical protein  34.95 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3776  hypothetical protein  34.95 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4124  hypothetical protein  34.95 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4340  hypothetical protein  34.78 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2225  hypothetical protein  37.84 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0394  electron transfer DM13  27.11 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>