21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1961 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1961  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  325  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1934  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  325  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4975  hypothetical protein  52.08 
 
 
144 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0394  electron transfer DM13  41.8 
 
 
151 aa  100  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0316  hypothetical protein  44.07 
 
 
178 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.961857  normal  0.636022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3736  hypothetical protein  42.34 
 
 
167 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2225  hypothetical protein  34.93 
 
 
208 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3238  hypothetical protein  34.81 
 
 
198 aa  77  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5513  secreted protein  43.43 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.390859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4264  hypothetical protein  29.63 
 
 
178 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238276  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1199  hypothetical protein  38.39 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4171  hypothetical protein  37.17 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0122  hypothetical protein  28.68 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151218  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4076  putative secreted protein  33.06 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.215347 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3791  hypothetical protein  36.44 
 
 
204 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179686  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  32.41 
 
 
334 aa  60.5  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0408  secreted protein  33.96 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121912 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3316  Electron transfer DM13  30.28 
 
 
191 aa  57.4  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.83711  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2510  Electron transfer DM13  34.55 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0416881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4662  hypothetical protein  29.59 
 
 
228 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4340  hypothetical protein  32 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>