26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4124 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0031  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  328  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3776  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  328  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4124  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  328  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4340  hypothetical protein  67.09 
 
 		 158 aa  235  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2454  hypothetical protein  51.66 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1738  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  51.02 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1231  hypothetical protein  51.02 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538059  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1649  hypothetical protein  51.02 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0355  hypothetical protein  51.02 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0064  hypothetical protein  51.02 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.64841  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1071  hypothetical protein  51.02 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0229  hypothetical protein  51.02 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1180  hypothetical protein  50.75 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4776  hypothetical protein  46.1 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0192522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0392  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  41.18 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0592  hypothetical protein  50.32 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1958  hypothetical protein  38.61 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0107464  normal  0.0222962 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000096  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  41.73 
 
 		 144 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.482372  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05161  hypothetical protein  42.57 
 
 		 163 aa  130  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4264  hypothetical protein  29.24 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0122  hypothetical protein  31 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3791  hypothetical protein  35.21 
 
 		 204 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4171  hypothetical protein  32.39 
 
 		 227 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0102  hypothetical protein  53.33 
 
 		 82 aa  44.3  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2510  Electron transfer DM13  34.95 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0416881 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5513  secreted protein  32.47 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.390859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>