24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0229 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0229  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  313  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1649  hypothetical protein  99.36 
 
 
156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1231  hypothetical protein  99.36 
 
 
156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538059  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1071  hypothetical protein  99.36 
 
 
156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1738  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  99.36 
 
 
156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0355  hypothetical protein  99.36 
 
 
156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0064  hypothetical protein  99.36 
 
 
156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.64841  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1180  hypothetical protein  85.26 
 
 
156 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2454  hypothetical protein  58.39 
 
 
167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4776  hypothetical protein  50.64 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0192522  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4124  hypothetical protein  51.02 
 
 
158 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3776  hypothetical protein  51.02 
 
 
158 aa  156  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0031  hypothetical protein  51.02 
 
 
158 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4340  hypothetical protein  45.7 
 
 
158 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0392  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  46.94 
 
 
155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0592  hypothetical protein  49.36 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65438  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000096  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  40.28 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.482372  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05161  hypothetical protein  39.46 
 
 
163 aa  128  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1958  hypothetical protein  38.78 
 
 
162 aa  127  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0107464  normal  0.0222962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4264  hypothetical protein  36.73 
 
 
178 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238276  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3791  hypothetical protein  35.56 
 
 
204 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179686  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4076  putative secreted protein  34.21 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.215347 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0102  hypothetical protein  65.38 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0122  hypothetical protein  32.37 
 
 
192 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151218  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>