22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0592 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0592  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  324  4.0000000000000003e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65438  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4776  hypothetical protein  51.28 
 
 
156 aa  184  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0192522  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2454  hypothetical protein  50.32 
 
 
167 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0031  hypothetical protein  50.32 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3776  hypothetical protein  50.32 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4124  hypothetical protein  50.32 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0392  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  50.64 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1071  hypothetical protein  49.36 
 
 
156 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0064  hypothetical protein  49.36 
 
 
156 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.64841  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0355  hypothetical protein  49.36 
 
 
156 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1738  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  49.36 
 
 
156 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1649  hypothetical protein  49.36 
 
 
156 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1231  hypothetical protein  49.36 
 
 
156 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538059  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0229  hypothetical protein  49.36 
 
 
156 aa  158  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4340  hypothetical protein  44.08 
 
 
158 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1958  hypothetical protein  42.31 
 
 
162 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0107464  normal  0.0222962 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05161  hypothetical protein  43.95 
 
 
163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000096  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  44.44 
 
 
144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.482372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1180  hypothetical protein  50.64 
 
 
156 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0102  hypothetical protein  63.64 
 
 
82 aa  50.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4264  hypothetical protein  38.57 
 
 
178 aa  44.7  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238276  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0408  secreted protein  25 
 
 
160 aa  40.8  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>