20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05161 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05161  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  338  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1958  hypothetical protein  51.92 
 
 
162 aa  180  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0107464  normal  0.0222962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4776  hypothetical protein  53.95 
 
 
156 aa  180  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0192522  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000096  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  55.56 
 
 
144 aa  169  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.482372  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0392  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  52.56 
 
 
155 aa  165  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2454  hypothetical protein  41.06 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0031  hypothetical protein  42.57 
 
 
158 aa  130  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3776  hypothetical protein  42.57 
 
 
158 aa  130  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4124  hypothetical protein  42.57 
 
 
158 aa  130  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1649  hypothetical protein  39.46 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0592  hypothetical protein  43.95 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65438  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1231  hypothetical protein  39.46 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538059  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1071  hypothetical protein  39.46 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1738  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  39.46 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0355  hypothetical protein  39.46 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0064  hypothetical protein  39.46 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.64841  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0229  hypothetical protein  39.46 
 
 
156 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4340  hypothetical protein  37.5 
 
 
158 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1180  hypothetical protein  39.47 
 
 
156 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  28.57 
 
 
334 aa  41.6  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>