17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0102 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0102  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  168  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4776  hypothetical protein  57.58 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0192522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000096  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  54.55 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.482372  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0392  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  60.61 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1958  hypothetical protein  45.95 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0107464  normal  0.0222962 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0031  hypothetical protein  53.33 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3776  hypothetical protein  53.33 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4124  hypothetical protein  53.33 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0355  hypothetical protein  65.38 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1231  hypothetical protein  65.38 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538059  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1649  hypothetical protein  65.38 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1738  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  65.38 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1071  hypothetical protein  65.38 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0064  hypothetical protein  65.38 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.64841  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1180  hypothetical protein  69.23 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0229  hypothetical protein  65.38 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2454  hypothetical protein  51.52 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>