12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2014 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2014  Electron transfer DM13  100 
 
 		 155 aa  304  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0367  putative lipoprotein  30.26 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0732  hypothetical protein  28.99 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0748  hypothetical protein  28.99 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.5991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3736  hypothetical protein  28.07 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4662  hypothetical protein  25 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0408  secreted protein  30.26 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121912 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  31.62 
 
 		 334 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3238  hypothetical protein  31.91 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5513  secreted protein  28.12 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.390859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4975  hypothetical protein  31.65 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4171  hypothetical protein  29.76 
 
 		 227 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>