241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0986 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0986  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
479 aa  989    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.461111 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1648  hypothetical protein  47.31 
 
 
572 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1087  hypothetical protein  51.65 
 
 
518 aa  107  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  49.45 
 
 
623 aa  103  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0467  hypothetical protein  47.25 
 
 
473 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0035824 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1636  hypothetical protein  50.56 
 
 
517 aa  102  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0973  hypothetical protein  33.57 
 
 
299 aa  98.6  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.149574 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1647  hypothetical protein  47.87 
 
 
531 aa  99  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0333  hypothetical protein  48.81 
 
 
1042 aa  95.5  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  41.67 
 
 
334 aa  87  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1638  hypothetical protein  37.37 
 
 
623 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0030  hypothetical protein  30.41 
 
 
334 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1644  hypothetical protein  34.48 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
1276 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  38.04 
 
 
191 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.99 
 
 
836 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0875  phosphonate ABC transporter periplasmic phosphonate-binding protein  49.02 
 
 
362 aa  62  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122737 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  27.78 
 
 
456 aa  62  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
617 aa  61.6  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.71 
 
 
397 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.08 
 
 
1056 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33 
 
 
632 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3141  tetratricopeptide TPR_2  33.6 
 
 
317 aa  61.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00286611  normal  0.0160397 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  29.03 
 
 
577 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  29.03 
 
 
577 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
245 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
4079 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1639  hypothetical protein  26.62 
 
 
443 aa  57.8  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  31.19 
 
 
734 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
3560 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
465 aa  57  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  31.18 
 
 
745 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
3035 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 
927 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.1 
 
 
784 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 
1069 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
543 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1255  hypothetical protein  31.96 
 
 
219 aa  56.6  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
213 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.3 
 
 
1138 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
217 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.63 
 
 
296 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
270 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.85 
 
 
730 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
270 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03628  N-terminal acetyltransferase catalytic subunit (NAT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11910)  30.71 
 
 
833 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108078  normal  0.314019 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
935 aa  54.7  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.66 
 
 
1979 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.8 
 
 
1007 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.23 
 
 
818 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 
716 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  30.69 
 
 
331 aa  53.9  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.73 
 
 
988 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
366 aa  53.5  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
1005 aa  53.5  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.73 
 
 
1056 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1618  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
241 aa  53.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  29.73 
 
 
623 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
213 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
784 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
391 aa  53.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.12 
 
 
810 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  28.79 
 
 
581 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  32.97 
 
 
560 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.13 
 
 
1034 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 
142 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
162 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1564  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
199 aa  52.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 
269 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0740  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
158 aa  52.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.773618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
416 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 
406 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 
406 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
221 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0438  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 
164 aa  51.6  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000401129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 
592 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
452 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2066  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.53 
 
 
257 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.585101  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
740 aa  51.2  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  20.75 
 
 
742 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.92 
 
 
620 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31 
 
 
1694 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2001  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
193 aa  51.2  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal  0.236756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
878 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  24.7 
 
 
306 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
804 aa  50.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
602 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.98 
 
 
1838 aa  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
574 aa  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1754  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
184 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.81 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0032  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
1445 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0479  phosphate ABC transporter periplasmic phosphate-binding protein  29.07 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.719284 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  29.17 
 
 
584 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.66 
 
 
1022 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
279 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.14 
 
 
155 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.32 
 
 
739 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
1192 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>