75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1307 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  355  9.999999999999999e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  79.27 
 
 		 167 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  33.79 
 
 		 456 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  42.11 
 
 		 239 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  35.78 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  43.42 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  40.79 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  42.11 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  42.5 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  42.11 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  36.14 
 
 		 539 aa  65.1  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  42.11 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  38.16 
 
 		 116 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  38.16 
 
 		 623 aa  61.6  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  34.31 
 
 		 315 aa  60.8  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  28.23 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  34.91 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  38.24 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  35.23 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  35.23 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  38.16 
 
 		 110 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 		 113 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  38.24 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  35.23 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  35.53 
 
 		 318 aa  55.1  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0875  phosphonate ABC transporter periplasmic phosphonate-binding protein  40.91 
 
 		 362 aa  54.3  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122737 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  32.47 
 
 		 114 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  30.61 
 
 		 131 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 		 113 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  28.36 
 
 		 336 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  35.8 
 
 		 454 aa  53.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 		 97 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0973  hypothetical protein  42.37 
 
 		 299 aa  52  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.149574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  34.21 
 
 		 192 aa  50.8  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  34.78 
 
 		 112 aa  50.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.58 
 
 		 417 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  35.53 
 
 		 771 aa  50.1  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3140  hypothetical protein  30.67 
 
 		 458 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0030  hypothetical protein  40.91 
 
 		 334 aa  49.7  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  32.91 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  38.46 
 
 		 334 aa  48.9  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  32.91 
 
 		 270 aa  48.9  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  35.82 
 
 		 125 aa  48.5  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  35.29 
 
 		 264 aa  48.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  32.93 
 
 		 301 aa  47.8  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  37.31 
 
 		 287 aa  47.8  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0340  blue (type1) copper domain-containing protein  37.29 
 
 		 130 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  32.35 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  32.89 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  35.53 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0467  hypothetical protein  41.46 
 
 		 473 aa  45.8  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0035824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  33.33 
 
 		 119 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  33.33 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0533  hypothetical protein  38.71 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.528363  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  34.33 
 
 		 119 aa  44.3  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  34.33 
 
 		 119 aa  44.3  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3552  blue (type 1) copper domain protein  26.09 
 
 		 119 aa  44.3  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0333  hypothetical protein  41.51 
 
 		 1042 aa  43.9  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  27.85 
 
 		 112 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  32.94 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  32.5 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  32.35 
 
 		 107 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1647  hypothetical protein  32.14 
 
 		 531 aa  42.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1921  blue (type1) copper domain-containing protein  33.75 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1638  hypothetical protein  39.62 
 
 		 623 aa  42  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  30.26 
 
 		 124 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  34.57 
 
 		 121 aa  41.6  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1439  hypothetical protein  32.47 
 
 		 103 aa  41.2  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0986  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 479 aa  41.2  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.461111 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1542  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 154 aa  40.8  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1636  hypothetical protein  41.03 
 
 		 517 aa  40.8  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>