39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3552 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3552  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 
119 aa  239  7.999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  35.37 
 
 
186 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  28.99 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1110  hypothetical protein  32.18 
 
 
464 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  31.33 
 
 
347 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  34.67 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  32.94 
 
 
212 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  32.93 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  31.76 
 
 
209 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  27.78 
 
 
192 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  26.09 
 
 
174 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  28.33 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  28.33 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  29.55 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  29.17 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  32 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  28.05 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  32.94 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  35.37 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  32.56 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  30.49 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  27.66 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  31.03 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  25.84 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  30 
 
 
231 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  30.56 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  35.9 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  27.5 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.32 
 
 
417 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  29.17 
 
 
205 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  31.58 
 
 
97 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  28.1 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  28.05 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  27.66 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  28.07 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  31.52 
 
 
209 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  33.8 
 
 
315 aa  40.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  25.2 
 
 
119 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>