116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2240 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  100 
 
 
119 aa  243  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  100 
 
 
119 aa  243  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  69.49 
 
 
125 aa  184  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  55.12 
 
 
127 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  62.5 
 
 
119 aa  154  6e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  60.36 
 
 
116 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  58.56 
 
 
116 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  58.56 
 
 
116 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  58.93 
 
 
116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  57.14 
 
 
128 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  53.78 
 
 
119 aa  143  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  62.63 
 
 
126 aa  141  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  55.46 
 
 
116 aa  140  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  55.46 
 
 
116 aa  140  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0152  plastocyanin  48.06 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  41.38 
 
 
139 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  44.25 
 
 
139 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  44.26 
 
 
133 aa  100  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  44.66 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  43.16 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  40 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  35.24 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  32.71 
 
 
347 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  36.17 
 
 
224 aa  61.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  35.51 
 
 
210 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  34.38 
 
 
292 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  33.9 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  34.69 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  39.58 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  38.89 
 
 
212 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  41.56 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  33.96 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  36.96 
 
 
179 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  32.93 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  38.46 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  42.19 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  37.78 
 
 
209 aa  57  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  34.55 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  32.93 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  30.95 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  38.78 
 
 
205 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  37.5 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  35.23 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  35.19 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  35.64 
 
 
160 aa  53.9  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  39.47 
 
 
72 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  33.33 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  33.33 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  34 
 
 
807 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  35.53 
 
 
116 aa  52  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  32.54 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  33.04 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  34.69 
 
 
147 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  34.02 
 
 
150 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  30.38 
 
 
119 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  37.65 
 
 
358 aa  51.6  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  28.57 
 
 
146 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  31.82 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  30.51 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  32 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  38.46 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  35.06 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  34.02 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  36.36 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  37.31 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  32.76 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  38.14 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  31.25 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  34.62 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  27.12 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  32.05 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  35.29 
 
 
235 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  31.62 
 
 
486 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1734  hypothetical protein  34.95 
 
 
276 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0063943  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  30.77 
 
 
146 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.33 
 
 
417 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  31.82 
 
 
179 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  34 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  30.93 
 
 
148 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  35.06 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  32.81 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  32.99 
 
 
168 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  32.69 
 
 
221 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  34 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  30.77 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  26.36 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  33.7 
 
 
231 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  34.33 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  34.21 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  31.07 
 
 
545 aa  43.9  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  28.33 
 
 
336 aa  43.9  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  29.69 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  28.21 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  27.78 
 
 
160 aa  42.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  28.07 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0215  putative amicyanin precursor protein  28.92 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  29.41 
 
 
192 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  29.69 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>