85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0561 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  100 
 
 		 119 aa  244  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  51.59 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  37.62 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  41.67 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  38.2 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  37.08 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  38.1 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  33.06 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.14 
 
 		 417 aa  60.5  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  36.26 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  34.71 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  36.26 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  37.36 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  36.26 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  34.23 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  37.68 
 
 		 444 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  36.14 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  38.55 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  26.98 
 
 		 539 aa  57  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  36.36 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  36.26 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  34.94 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  38.03 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  34.52 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  34.48 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  33.78 
 
 		 486 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  33.73 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  31.53 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  27.52 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  30.25 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  33.33 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  32.35 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  31.36 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  31.36 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  30.12 
 
 		 116 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  32.5 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  34 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  31.4 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.72 
 
 		 749 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  35.53 
 
 		 239 aa  50.1  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  33 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  34.62 
 
 		 358 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  29.7 
 
 		 264 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  32.35 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  32.58 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  30 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  30.49 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  28.46 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  32.61 
 
 		 336 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  36.84 
 
 		 771 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  32 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0215  putative amicyanin precursor protein  25.69 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 174 aa  47  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  33.66 
 
 		 192 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0493  blue (type1) copper domain-containing protein  30.69 
 
 		 318 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  30.69 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  31.58 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  29.35 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  27.27 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  32.35 
 
 		 315 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  31.94 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  30.69 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  31.33 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  31 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0340  blue (type1) copper domain-containing protein  36.07 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  31.03 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  35.21 
 
 		 623 aa  44.3  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  28.17 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  26.19 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  37.5 
 
 		 318 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1921  blue (type1) copper domain-containing protein  28.91 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  31.87 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  30.21 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  29.69 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  29.31 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3424  hypothetical protein  26.51 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185141  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3552  blue (type 1) copper domain protein  25.84 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  26.19 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1542  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  37.5 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1195  hypothetical protein  27.63 
 
 		 372 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  27.71 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  27.62 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  23.93 
 
 		 123 aa  40  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>