99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1272 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  239  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  85.09 
 
 		 114 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  72.12 
 
 		 110 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  63.96 
 
 		 112 aa  147  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  63.96 
 
 		 112 aa  147  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  65.38 
 
 		 113 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  63.96 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  74.42 
 
 		 113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  74.42 
 
 		 113 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  56.82 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  44.44 
 
 		 179 aa  89.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  51.76 
 
 		 110 aa  88.6  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  44.9 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  48.72 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  44.3 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  45.83 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  46.15 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0340  blue (type1) copper domain-containing protein  52.56 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  43.59 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  44.16 
 
 		 417 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  37.66 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  34.62 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  28.81 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  41.57 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  38.57 
 
 		 444 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  37.18 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.66 
 
 		 749 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  38.03 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  38.38 
 
 		 264 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  32.98 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  34.78 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  34.21 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  34.62 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1921  blue (type1) copper domain-containing protein  40.74 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  38.24 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0215  putative amicyanin precursor protein  32.38 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  33.78 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  35.53 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  36.26 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  33.77 
 
 		 358 aa  54.7  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  35 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  32.47 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  32.5 
 
 		 315 aa  52.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  28.42 
 
 		 623 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  34.41 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  32.95 
 
 		 336 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  34.38 
 
 		 318 aa  52  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  30.43 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  32.05 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  30.28 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3984  blue (type 1) copper domain protein  39.24 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0137128  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  30.88 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  29.21 
 
 		 539 aa  50.4  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  32.63 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1110  hypothetical protein  37.8 
 
 		 464 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  32 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3140  hypothetical protein  26.72 
 
 		 458 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  28.95 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  29.41 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  38.75 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  31.25 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3225  cell surface lipoprotein  29.11 
 
 		 218 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00779237  normal  0.0523754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4398  hypothetical protein  33.01 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2773  hypothetical protein  30.43 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  29.11 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  33.78 
 
 		 287 aa  46.2  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3000  hypothetical protein  29.57 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0511761 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  32.71 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2950  hypothetical protein  29.73 
 
 		 994 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290707 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  24.79 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  32.14 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  27.43 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1734  hypothetical protein  29.36 
 
 		 276 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0063943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  29.69 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  29.69 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3552  blue (type 1) copper domain protein  30.49 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1195  hypothetical protein  35.71 
 
 		 372 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2896  hypothetical protein  27.87 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1142  blue (type1) copper domain-containing protein  34.07 
 
 		 153 aa  42  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.036139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  31.65 
 
 		 173 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  28.21 
 
 		 105 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  31.65 
 
 		 255 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  25.4 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  32.35 
 
 		 347 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1566  plastocyanin/azurin family copper binding protein  28.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0060  hypothetical protein  28.4 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  31.08 
 
 		 230 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1216  hypothetical protein  28.4 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1499  hypothetical protein  28.4 
 
 		 124 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  25.64 
 
 		 280 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0072  hypothetical protein  28.4 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  31.17 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0071  plastocyanin/azurin family copper binding protein  28.4 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0088  plastocyanin/azurin family copper binding protein  28.4 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  33.77 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  31.17 
 
 		 454 aa  40.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>