107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1244 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 
173 aa  352  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  48.62 
 
 
235 aa  101  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  47.87 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  48.42 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  37.78 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  33.6 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  35.29 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  33.54 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  33.54 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  35.4 
 
 
127 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  40 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  40.43 
 
 
623 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  36.04 
 
 
119 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  36.04 
 
 
119 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  33.56 
 
 
144 aa  62.4  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  37.23 
 
 
205 aa  61.6  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  34.17 
 
 
150 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  32.06 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  30.83 
 
 
116 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  33.66 
 
 
147 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  34.31 
 
 
160 aa  58.5  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  30.56 
 
 
119 aa  58.2  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  30.6 
 
 
114 aa  57.8  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  32.41 
 
 
126 aa  57.4  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  29.58 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  34.69 
 
 
137 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  28.33 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  32.06 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  29.17 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  30 
 
 
116 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  36.56 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  33.05 
 
 
212 aa  55.5  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  31.33 
 
 
144 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  31.43 
 
 
116 aa  54.3  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  28.87 
 
 
146 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  31.43 
 
 
116 aa  54.3  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  31.2 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  26.57 
 
 
347 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  28.33 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  38.55 
 
 
336 aa  52.4  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  33.93 
 
 
150 aa  52.4  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  28.18 
 
 
104 aa  52  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  34.12 
 
 
152 aa  52  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  30.09 
 
 
144 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  29.91 
 
 
210 aa  52  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  31.58 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  32.26 
 
 
139 aa  51.2  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  31.82 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  34.04 
 
 
358 aa  50.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  30 
 
 
116 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  31.03 
 
 
72 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0493  blue (type1) copper domain-containing protein  35.71 
 
 
318 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  29.79 
 
 
119 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  29.27 
 
 
139 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  29.69 
 
 
545 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  31.86 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  33.57 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  29.66 
 
 
173 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  31.09 
 
 
141 aa  48.5  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  30.25 
 
 
280 aa  48.1  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  31.03 
 
 
120 aa  47.8  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  32.08 
 
 
807 aa  47.8  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  29.31 
 
 
147 aa  47.4  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  34.52 
 
 
131 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  32.94 
 
 
318 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  32.89 
 
 
444 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  30.08 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  31.91 
 
 
231 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  31.07 
 
 
144 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0340  blue (type1) copper domain-containing protein  40.38 
 
 
130 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  32.95 
 
 
187 aa  45.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  28.7 
 
 
146 aa  45.1  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  31.06 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  30.7 
 
 
301 aa  44.7  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  41.56 
 
 
315 aa  44.7  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  30.77 
 
 
136 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30 
 
 
417 aa  44.7  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  31.58 
 
 
179 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  25.24 
 
 
179 aa  45.1  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  29.81 
 
 
146 aa  44.7  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  37.88 
 
 
239 aa  44.7  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  28.35 
 
 
112 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  28.35 
 
 
112 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  32.89 
 
 
97 aa  44.3  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  31.46 
 
 
145 aa  44.3  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  32.18 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  28.47 
 
 
264 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  31.85 
 
 
454 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  29.21 
 
 
109 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  26.17 
 
 
146 aa  42  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  32.94 
 
 
112 aa  42  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  30 
 
 
486 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  30.61 
 
 
141 aa  42  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  31.25 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  30.1 
 
 
172 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  35.06 
 
 
157 aa  42  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  30.77 
 
 
110 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  26.17 
 
 
168 aa  42  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  31.25 
 
 
114 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  32.18 
 
 
150 aa  41.6  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>