21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2950 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3141  hypothetical protein  73.35 
 
 		 525 aa  772    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2950  hypothetical protein  100 
 
 		 994 aa  2018    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2605  hypothetical protein  72.2 
 
 		 982 aa  1405    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.715518  normal  0.847276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3140  hypothetical protein  73.36 
 
 		 458 aa  629  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1368  transmembrane domain-containing protein  43.27 
 
 		 850 aa  365  3e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.509572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2085  G8 domain-containing protein  36.1 
 
 		 920 aa  299  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.304912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27441  predicted protein  29.57 
 
 		 3191 aa  156  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3452  hypothetical protein  30.4 
 
 		 710 aa  151  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46560  predicted protein  28.28 
 
 		 1245 aa  143  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.585047  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48753  predicted protein  29.04 
 
 		 1110 aa  142  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46559  predicted protein  27.42 
 
 		 1009 aa  140  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46563  predicted protein  28.15 
 
 		 1245 aa  140  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629816  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47839  predicted protein  30.11 
 
 		 922 aa  139  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759183  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42685  predicted protein  27.82 
 
 		 847 aa  136  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0260166  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1758  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1320 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0717  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1457 aa  107  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0836  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1436 aa  98.6  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  23.89 
 
 		 1502 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  24.24 
 
 		 1394 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  42.37 
 
 		 85 aa  52.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  33.85 
 
 		 114 aa  45.8  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>