17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42685 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48753  predicted protein  49.3 
 
 		 1110 aa  739    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46563  predicted protein  52.46 
 
 		 1245 aa  800    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629816  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46560  predicted protein  52.07 
 
 		 1245 aa  795    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.585047  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46559  predicted protein  48.67 
 
 		 1009 aa  776    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42685  predicted protein  100 
 
 		 847 aa  1753    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0260166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2085  G8 domain-containing protein  31.96 
 
 		 920 aa  174  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.304912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1368  transmembrane domain-containing protein  30.58 
 
 		 850 aa  164  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.509572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2605  hypothetical protein  31.17 
 
 		 982 aa  143  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.715518  normal  0.847276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2950  hypothetical protein  27.82 
 
 		 994 aa  136  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3452  hypothetical protein  26 
 
 		 710 aa  110  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47839  predicted protein  26.19 
 
 		 922 aa  105  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759183  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27441  predicted protein  26.1 
 
 		 3191 aa  105  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0717  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1457 aa  98.2  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0836  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1436 aa  95.5  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1758  hypothetical protein  34.64 
 
 		 1320 aa  87.8  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3140  hypothetical protein  27.87 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  22.57 
 
 		 1502 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>