24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46563 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48753  predicted protein  71.57 
 
 
1110 aa  1403    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46563  predicted protein  100 
 
 
1245 aa  2586    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629816  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46560  predicted protein  97.11 
 
 
1245 aa  2498    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.585047  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46559  predicted protein  86.73 
 
 
1009 aa  1767    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42685  predicted protein  52.16 
 
 
847 aa  806    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0260166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2085  G8 domain-containing protein  33.64 
 
 
920 aa  174  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.304912  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1368  transmembrane domain-containing protein  31.67 
 
 
850 aa  169  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.509572 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46378  predicted protein  38.95 
 
 
509 aa  155  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2605  hypothetical protein  28.21 
 
 
982 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.715518  normal  0.847276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2950  hypothetical protein  28.15 
 
 
994 aa  140  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290707 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47839  predicted protein  32.12 
 
 
922 aa  125  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759183  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3452  hypothetical protein  25.8 
 
 
710 aa  114  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49209  predicted protein  29.53 
 
 
526 aa  110  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0370698  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27441  predicted protein  27.93 
 
 
3191 aa  106  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1758  hypothetical protein  37.25 
 
 
1320 aa  95.5  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0836  hypothetical protein  36.08 
 
 
1436 aa  95.5  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0717  hypothetical protein  35.44 
 
 
1457 aa  94  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3140  hypothetical protein  27.3 
 
 
458 aa  80.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  21.72 
 
 
1502 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  42 
 
 
840 aa  48.9  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  32.32 
 
 
551 aa  48.9  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  44.07 
 
 
472 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  28.23 
 
 
1217 aa  47.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  21.66 
 
 
1394 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>