19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46559 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48753  predicted protein  68.22 
 
 		 1110 aa  1313    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46563  predicted protein  86.73 
 
 		 1245 aa  1766    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629816  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46560  predicted protein  87.33 
 
 		 1245 aa  1784    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.585047  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46559  predicted protein  100 
 
 		 1009 aa  2098    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42685  predicted protein  48.45 
 
 		 847 aa  782    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0260166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2085  G8 domain-containing protein  32.03 
 
 		 920 aa  164  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.304912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1368  transmembrane domain-containing protein  30.16 
 
 		 850 aa  162  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.509572 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46378  predicted protein  39.27 
 
 		 509 aa  159  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2605  hypothetical protein  27.87 
 
 		 982 aa  157  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.715518  normal  0.847276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2950  hypothetical protein  27.42 
 
 		 994 aa  140  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290707 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47839  predicted protein  31.67 
 
 		 922 aa  119  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759183  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3452  hypothetical protein  26.84 
 
 		 710 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49209  predicted protein  32.52 
 
 		 526 aa  101  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0370698  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27441  predicted protein  29.54 
 
 		 3191 aa  101  8e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0836  hypothetical protein  37.34 
 
 		 1436 aa  95.9  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1758  hypothetical protein  35.95 
 
 		 1320 aa  95.1  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0717  hypothetical protein  35.44 
 
 		 1457 aa  93.6  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3140  hypothetical protein  26.8 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  23.88 
 
 		 1502 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>