16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1758 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0717  hypothetical protein  41.67 
 
 
1457 aa  888    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0836  hypothetical protein  42.01 
 
 
1436 aa  897    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1758  hypothetical protein  100 
 
 
1320 aa  2735    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2085  G8 domain-containing protein  32.01 
 
 
920 aa  140  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.304912  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1368  transmembrane domain-containing protein  29.83 
 
 
850 aa  115  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.509572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2950  hypothetical protein  31.16 
 
 
994 aa  114  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2605  hypothetical protein  27.57 
 
 
982 aa  107  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.715518  normal  0.847276 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48753  predicted protein  38.56 
 
 
1110 aa  96.3  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46563  predicted protein  37.25 
 
 
1245 aa  95.5  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629816  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46559  predicted protein  35.95 
 
 
1009 aa  95.1  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46560  predicted protein  35.29 
 
 
1245 aa  92.8  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.585047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3452  hypothetical protein  27.97 
 
 
710 aa  91.7  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42685  predicted protein  34.64 
 
 
847 aa  87.8  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0260166  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47839  predicted protein  27.3 
 
 
922 aa  86.7  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759183  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27441  predicted protein  23.7 
 
 
3191 aa  70.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3140  hypothetical protein  27.51 
 
 
458 aa  58.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.182787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>