32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3140 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2950  hypothetical protein  73.36 
 
 		 994 aa  651    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3140  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  931    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2605  hypothetical protein  69.72 
 
 		 982 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.715518  normal  0.847276 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1368  transmembrane domain-containing protein  44.59 
 
 		 850 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.509572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2085  G8 domain-containing protein  38.91 
 
 		 920 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.304912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27441  predicted protein  29.71 
 
 		 3191 aa  97.8  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47839  predicted protein  28.27 
 
 		 922 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759183  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3452  hypothetical protein  27.7 
 
 		 710 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42685  predicted protein  29.22 
 
 		 847 aa  87.8  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0260166  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46559  predicted protein  27.41 
 
 		 1009 aa  84.3  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46563  predicted protein  27.27 
 
 		 1245 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629816  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46560  predicted protein  27.94 
 
 		 1245 aa  81.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.585047  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48753  predicted protein  28.38 
 
 		 1110 aa  79.7  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1758  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1320 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  32.04 
 
 		 114 aa  53.9  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  31.88 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  32.86 
 
 		 72 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  32.88 
 
 		 179 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0717  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1457 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  30.67 
 
 		 174 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  34.67 
 
 		 315 aa  48.9  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  35.71 
 
 		 85 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  31.88 
 
 		 114 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  22.98 
 
 		 1394 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  32.38 
 
 		 192 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  31.43 
 
 		 114 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  23.21 
 
 		 1502 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  29.27 
 
 		 270 aa  47  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0836  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1436 aa  47  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  28 
 
 		 239 aa  45.1  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  26.67 
 
 		 167 aa  44.3  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  27.14 
 
 		 113 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>