19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48753 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48753  predicted protein  100 
 
 
1110 aa  2296    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46563  predicted protein  71.37 
 
 
1245 aa  1379    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629816  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46560  predicted protein  71.47 
 
 
1245 aa  1381    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.585047  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46559  predicted protein  68.22 
 
 
1009 aa  1287    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42685  predicted protein  49.3 
 
 
847 aa  739    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0260166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2085  G8 domain-containing protein  32.51 
 
 
920 aa  177  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.304912  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1368  transmembrane domain-containing protein  30.36 
 
 
850 aa  175  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.509572 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46378  predicted protein  38.54 
 
 
509 aa  151  9e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2605  hypothetical protein  28.6 
 
 
982 aa  145  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.715518  normal  0.847276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2950  hypothetical protein  29.04 
 
 
994 aa  142  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290707 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47839  predicted protein  32.13 
 
 
922 aa  120  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759183  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3452  hypothetical protein  27.19 
 
 
710 aa  112  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49209  predicted protein  32.64 
 
 
526 aa  112  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0370698  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27441  predicted protein  27.56 
 
 
3191 aa  111  9.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0836  hypothetical protein  33.96 
 
 
1436 aa  99.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0717  hypothetical protein  34.36 
 
 
1457 aa  99  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1758  hypothetical protein  38.56 
 
 
1320 aa  96.3  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3140  hypothetical protein  27.87 
 
 
458 aa  75.5  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  22.59 
 
 
1502 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>