18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47839 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47839  predicted protein  100 
 
 		 922 aa  1909    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759183  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1368  transmembrane domain-containing protein  26.23 
 
 		 850 aa  179  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.509572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2085  G8 domain-containing protein  28.54 
 
 		 920 aa  162  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.304912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2605  hypothetical protein  29.03 
 
 		 982 aa  140  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.715518  normal  0.847276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2950  hypothetical protein  30.11 
 
 		 994 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290707 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46563  predicted protein  32.12 
 
 		 1245 aa  125  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629816  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48753  predicted protein  32.13 
 
 		 1110 aa  121  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46560  predicted protein  29.19 
 
 		 1245 aa  120  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.585047  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46559  predicted protein  31.67 
 
 		 1009 aa  119  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3452  hypothetical protein  27.78 
 
 		 710 aa  109  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27441  predicted protein  25.23 
 
 		 3191 aa  108  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42685  predicted protein  26.19 
 
 		 847 aa  105  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0260166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3140  hypothetical protein  28.27 
 
 		 458 aa  91.3  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1758  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1320 aa  87  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0717  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1457 aa  75.5  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0836  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1436 aa  75.5  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  22.67 
 
 		 1502 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  21.94 
 
 		 1394 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>