57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1173 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  100 
 
 		 136 aa  268  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  59.6 
 
 		 347 aa  116  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  56.38 
 
 		 186 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  56.31 
 
 		 205 aa  104  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  51.55 
 
 		 231 aa  96.3  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  38.22 
 
 		 160 aa  89.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  47.96 
 
 		 209 aa  84.3  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  47.42 
 
 		 212 aa  84  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  34.46 
 
 		 218 aa  80.9  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  46.96 
 
 		 209 aa  80.9  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  45.71 
 
 		 179 aa  80.5  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  43.4 
 
 		 292 aa  77.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  45.19 
 
 		 210 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  43.69 
 
 		 224 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0645  blue (type 1) copper domain protein  46.53 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375984  normal  0.285724 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  33.77 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  38.3 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  37.18 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  39 
 
 		 807 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  37.36 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  31.41 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  34.02 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  40.74 
 
 		 179 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  34.45 
 
 		 221 aa  50.1  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  34.02 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  33 
 
 		 110 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  37.97 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  35.9 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  38.27 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  32.61 
 
 		 235 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  38.2 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  31.37 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  30.25 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  35.48 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  32.2 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  32.65 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  33.81 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  36 
 
 		 444 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  34.02 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3552  blue (type 1) copper domain protein  35.21 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  33.33 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  32.99 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  32.99 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  29.49 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  32.32 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  32.2 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  32.99 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  34.67 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  31.96 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  36.49 
 
 		 264 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.36 
 
 		 417 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  33.77 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  29.35 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  31.15 
 
 		 301 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  35.06 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  32.05 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  35.9 
 
 		 112 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>