25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0583 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 209 aa  417  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0645  blue (type 1) copper domain protein  72.91 
 
 		 214 aa  257  7e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375984  normal  0.285724 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  43.87 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  41.06 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  45.83 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  50.94 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  45.64 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  39.49 
 
 		 224 aa  91.7  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  37.07 
 
 		 347 aa  85.5  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  45.71 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  46.96 
 
 		 136 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  42.86 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  34.57 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  29.83 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  30.66 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  32.99 
 
 		 153 aa  48.5  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  31.13 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  30.85 
 
 		 151 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  35.48 
 
 		 125 aa  45.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  34.09 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  27.35 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  27.78 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  32.95 
 
 		 146 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  31.46 
 
 		 147 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  29.9 
 
 		 152 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>