69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0739 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  100 
 
 
160 aa  322  1e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  50 
 
 
179 aa  124  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  48.59 
 
 
347 aa  121  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  46.72 
 
 
205 aa  110  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  49.14 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  51.16 
 
 
186 aa  107  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  47.41 
 
 
212 aa  105  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  48.28 
 
 
224 aa  103  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  49.11 
 
 
210 aa  97.8  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  42.31 
 
 
292 aa  95.1  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  43.48 
 
 
231 aa  89.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  46.53 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  32.99 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  43.16 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0645  blue (type 1) copper domain protein  40.95 
 
 
214 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375984  normal  0.285724 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  29.1 
 
 
235 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  30.64 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  36.89 
 
 
116 aa  58.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  34.31 
 
 
173 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  38.61 
 
 
144 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  32.63 
 
 
148 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  35.92 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  36.89 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  38.38 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  32.63 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  32.98 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  35.9 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  34.95 
 
 
116 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  34.74 
 
 
125 aa  55.1  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  29.05 
 
 
137 aa  54.7  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  35.64 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  35.64 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  36.84 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  31.63 
 
 
807 aa  52.4  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  35.35 
 
 
147 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  33.66 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  29.05 
 
 
146 aa  51.2  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  36.67 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  41.38 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  37.18 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  31.43 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  31.03 
 
 
221 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  32.67 
 
 
126 aa  48.5  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  30.69 
 
 
116 aa  48.5  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  33.66 
 
 
128 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  40.28 
 
 
179 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  34.29 
 
 
486 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  30.39 
 
 
127 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  31.31 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  32.53 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3552  blue (type 1) copper domain protein  32.93 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  36.96 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  27.78 
 
 
146 aa  44.3  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  37.66 
 
 
161 aa  44.3  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  28.42 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  33.67 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  28.42 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  29.13 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  32.91 
 
 
119 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.33 
 
 
749 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  32.91 
 
 
114 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  29.81 
 
 
111 aa  42.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  30.69 
 
 
151 aa  42  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  35.29 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  28.28 
 
 
168 aa  41.2  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  31.03 
 
 
255 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  28.87 
 
 
173 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  28.28 
 
 
146 aa  41.2  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  32.98 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>