56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0581 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  100 
 
 		 212 aa  430  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  73.13 
 
 		 209 aa  264  5.999999999999999e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  53.12 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0645  blue (type 1) copper domain protein  46.33 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375984  normal  0.285724 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  43.19 
 
 		 347 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  47.85 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  51.61 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  55.65 
 
 		 186 aa  112  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  41.51 
 
 		 160 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  43.64 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  50 
 
 		 179 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  53 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  47.42 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  32.79 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  41.74 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  36.67 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  36.67 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  38.89 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  33.05 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  35.05 
 
 		 807 aa  55.5  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  35.56 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  31.67 
 
 		 144 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  30.36 
 
 		 138 aa  52.8  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  34.44 
 
 		 116 aa  51.6  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  29.57 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  28.21 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  34.44 
 
 		 126 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  35.56 
 
 		 116 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  34.44 
 
 		 116 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  36.9 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  35.56 
 
 		 128 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  39.73 
 
 		 157 aa  48.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3552  blue (type 1) copper domain protein  32.94 
 
 		 119 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  39.24 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  33.33 
 
 		 116 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  34.44 
 
 		 116 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  32.99 
 
 		 146 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  32.22 
 
 		 119 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  26.4 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  40.7 
 
 		 150 aa  45.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  30.11 
 
 		 137 aa  45.1  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  33.33 
 
 		 116 aa  45.1  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  37.35 
 
 		 110 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  28.95 
 
 		 127 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  30.47 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  34.09 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  26.4 
 
 		 152 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  28.32 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  30.36 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  28.07 
 
 		 148 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  32.94 
 
 		 114 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  28.07 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  28.57 
 
 		 152 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  28.57 
 
 		 104 aa  42  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  29.66 
 
 		 264 aa  42  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.85 
 
 		 417 aa  42  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>