27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2576 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  100 
 
 
218 aa  415  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  43.75 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  42.76 
 
 
186 aa  98.2  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  43.94 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  39.46 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  37.72 
 
 
292 aa  89  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  31.96 
 
 
160 aa  85.9  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  40.77 
 
 
179 aa  85.5  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  40.91 
 
 
136 aa  85.1  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  35.33 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  34.39 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  36.11 
 
 
210 aa  72  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  32.91 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  30.17 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  33.57 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0645  blue (type 1) copper domain protein  32.58 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375984  normal  0.285724 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  28.49 
 
 
146 aa  55.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  27.83 
 
 
235 aa  55.1  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  32.17 
 
 
221 aa  54.7  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  32.74 
 
 
137 aa  52.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  32.46 
 
 
144 aa  52.4  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  32.31 
 
 
125 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  28.81 
 
 
110 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  20.86 
 
 
140 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  31.78 
 
 
807 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  26.45 
 
 
119 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  26.45 
 
 
119 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>