59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1663 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  100 
 
 
153 aa  312  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  51.66 
 
 
151 aa  149  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  57.94 
 
 
150 aa  144  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  47.59 
 
 
151 aa  144  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  50.34 
 
 
146 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  49.66 
 
 
173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  44.88 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  46.72 
 
 
147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  48.03 
 
 
141 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  41.35 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  45.24 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  51.89 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  46.77 
 
 
157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  51.89 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  42.74 
 
 
187 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  41.67 
 
 
146 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  45.13 
 
 
147 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  48.57 
 
 
163 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  42.74 
 
 
146 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  42.02 
 
 
168 aa  101  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  41.91 
 
 
161 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  41.54 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  44.66 
 
 
149 aa  96.7  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  43.75 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  44.09 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  42.97 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  38.1 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  44.86 
 
 
144 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  42.06 
 
 
144 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  36.62 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  35.38 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  35.77 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  34.29 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  32.81 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  32.17 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  34.45 
 
 
125 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  32.48 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  32.97 
 
 
209 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  33.33 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  30.77 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  32.81 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  33.65 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  32.81 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  33.65 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  32.98 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  29.6 
 
 
221 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  33.64 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  29.66 
 
 
255 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  30.51 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  31.58 
 
 
347 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0645  blue (type 1) copper domain protein  30.77 
 
 
214 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375984  normal  0.285724 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  32.98 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  32.98 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  32.98 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  30.28 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  26.23 
 
 
235 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  32.98 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  27.37 
 
 
140 aa  40.8  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  33.33 
 
 
131 aa  40.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>