44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2983 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  100 
 
 		 143 aa  289  9e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  56.91 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  50.34 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  50 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  47.26 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  48.78 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  50 
 
 		 173 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  59.57 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  45.31 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  44.14 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  47.37 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  52 
 
 		 151 aa  110  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  49.45 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  52.17 
 
 		 187 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  41.43 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  47.83 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  43.75 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  40.34 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  42.37 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  46.94 
 
 		 146 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  39.66 
 
 		 146 aa  97.4  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  39.66 
 
 		 168 aa  97.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  45.92 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  39.83 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  44 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  39.23 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  42.86 
 
 		 157 aa  86.7  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  39.84 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  39.84 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  38.94 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  37.4 
 
 		 163 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  35.71 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  30.3 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  30.97 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  32.69 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  29.82 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  29.82 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  29.09 
 
 		 347 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  28.45 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  31.31 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  31.73 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  31.43 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  28.95 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  25.37 
 
 		 221 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>