64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6221 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  100 
 
 		 149 aa  295  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  57.46 
 
 		 151 aa  156  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  60.83 
 
 		 147 aa  153  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  50.74 
 
 		 151 aa  146  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  47.22 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  57.14 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  56.9 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  57.72 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  53.66 
 
 		 146 aa  131  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  53.66 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  53.6 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  55.12 
 
 		 146 aa  126  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  49.31 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  45.14 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  43.48 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  50.41 
 
 		 187 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  49.18 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  42.45 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  44.12 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  51.26 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  44.37 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  45.13 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  42.86 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  44.44 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  48.36 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  43.65 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  45.22 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  43.8 
 
 		 161 aa  98.2  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  48.35 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  43.1 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  43.1 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  38.35 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  35.96 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  32.28 
 
 		 255 aa  60.1  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  32.21 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  35.4 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  35.4 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  32.2 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  34.92 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  31.67 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  30.58 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  28 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  32.63 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  33.05 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  38.1 
 
 		 347 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  34.04 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  34.04 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  32.23 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  34.78 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  30.4 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  30 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  30.89 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  29.2 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  31.3 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  31.36 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  31.03 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  31.25 
 
 		 235 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  31.36 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  27.61 
 
 		 545 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  34.18 
 
 		 109 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  28.7 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  32.58 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  28.28 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  30.12 
 
 		 292 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>