78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1871 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 
221 aa  440  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  49.31 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  47.87 
 
 
173 aa  82  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  75.1  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  38.24 
 
 
138 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  32.3 
 
 
179 aa  62.4  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  40 
 
 
205 aa  62.4  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  35.92 
 
 
146 aa  61.6  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  36.04 
 
 
347 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  32.77 
 
 
147 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  33.88 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  27.74 
 
 
152 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  34.26 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  38.38 
 
 
137 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  32.09 
 
 
160 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  31.82 
 
 
152 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  36.27 
 
 
145 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  29.52 
 
 
147 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  33.04 
 
 
140 aa  55.8  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  35.51 
 
 
127 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  29.41 
 
 
150 aa  52.4  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  38.32 
 
 
454 aa  52.4  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  30.07 
 
 
218 aa  52.4  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  30.16 
 
 
144 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  29.2 
 
 
141 aa  51.6  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  36.26 
 
 
292 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  30.97 
 
 
151 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  36.26 
 
 
150 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  31.31 
 
 
116 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  36.19 
 
 
144 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  31.73 
 
 
125 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  32.94 
 
 
161 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  52.5 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  31.31 
 
 
116 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  38.78 
 
 
186 aa  50.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  37.14 
 
 
545 aa  49.7  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  30.39 
 
 
146 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  34.31 
 
 
116 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  32.38 
 
 
126 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  33.33 
 
 
116 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  34.45 
 
 
136 aa  48.9  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  34.65 
 
 
807 aa  48.5  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  28.57 
 
 
146 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  28.57 
 
 
148 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  31.91 
 
 
144 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
110 aa  48.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  29.03 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  33.33 
 
 
116 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  50 
 
 
209 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  32 
 
 
172 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  31.43 
 
 
119 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  34.31 
 
 
116 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  31.37 
 
 
128 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  62.5 
 
 
146 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  34.83 
 
 
358 aa  45.8  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  40.22 
 
 
270 aa  45.4  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  30.56 
 
 
104 aa  45.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  29.6 
 
 
153 aa  45.1  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  32.69 
 
 
119 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  28.12 
 
 
173 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  32.69 
 
 
119 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  48.84 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  30.77 
 
 
144 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  28.89 
 
 
144 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  26.36 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  33.01 
 
 
141 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  26.67 
 
 
147 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  30.11 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  26.36 
 
 
168 aa  43.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  38.57 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  37.14 
 
 
1287 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  31.18 
 
 
112 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  30.36 
 
 
139 aa  42.4  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  29.36 
 
 
133 aa  42  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  30.85 
 
 
187 aa  42  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  31.52 
 
 
151 aa  41.6  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  30.83 
 
 
318 aa  41.6  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  26.92 
 
 
146 aa  41.6  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>