59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1139 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  100 
 
 		 150 aa  303  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  52.82 
 
 		 144 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  51.61 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  50.79 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  46.04 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  44.68 
 
 		 173 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  49.21 
 
 		 150 aa  123  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  58.06 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  43.07 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  43.36 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  41.89 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  44.17 
 
 		 187 aa  117  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  46.49 
 
 		 146 aa  116  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  45 
 
 		 146 aa  113  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  46.09 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  42.86 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  44.07 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  42.86 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  52.04 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  51.55 
 
 		 146 aa  103  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  44.23 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  44.07 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  50.53 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  38.1 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  37.59 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  37.59 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  42.76 
 
 		 161 aa  97.4  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  38.1 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  36.97 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  36.97 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  35.59 
 
 		 163 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  30.77 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  30.33 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  36.89 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  27.97 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  35.83 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  29.41 
 
 		 221 aa  53.5  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  33.33 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  33.33 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  35.83 
 
 		 116 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  36.44 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  34.55 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  33.09 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  34.02 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  26.56 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  35.92 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  33.98 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  35.96 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  30.16 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  30.97 
 
 		 235 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  29.84 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  29.84 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  31.3 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  30.28 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  30.95 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  29.2 
 
 		 255 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  31.4 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  29.31 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  30.28 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>