39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2563 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  100 
 
 
133 aa  271  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  53.98 
 
 
139 aa  117  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  49.11 
 
 
139 aa  117  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  42.31 
 
 
119 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  42.31 
 
 
119 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  41.41 
 
 
127 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0152  plastocyanin  36.15 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260566 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  36.03 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  39.23 
 
 
119 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  37.69 
 
 
119 aa  89.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  36.92 
 
 
126 aa  87.4  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  40.48 
 
 
116 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  38.52 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  40.48 
 
 
116 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  40.52 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  40.32 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  38.71 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  38.71 
 
 
116 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  39.09 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  33.04 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  31.63 
 
 
205 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  29.82 
 
 
807 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  34.02 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  32.26 
 
 
110 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  32.61 
 
 
347 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  28.69 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  33.9 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  31.58 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  36.36 
 
 
161 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  31.87 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  25.9 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  26.09 
 
 
235 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  29.36 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  33.93 
 
 
144 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  30.28 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0280  blue (type 1) copper domain protein  32.41 
 
 
188 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  31.46 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  38.46 
 
 
147 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>