36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4110 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  100 
 
 
187 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  70 
 
 
146 aa  184  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  59.35 
 
 
146 aa  158  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  51.25 
 
 
173 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  57.38 
 
 
150 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  52.99 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  51.64 
 
 
151 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  55.83 
 
 
147 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  52.89 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  52.1 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  52.89 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  47.52 
 
 
147 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  46.67 
 
 
163 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  48.33 
 
 
147 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  41.06 
 
 
150 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  46.67 
 
 
152 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  46.67 
 
 
152 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  52.94 
 
 
157 aa  117  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  49.15 
 
 
144 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  47.46 
 
 
144 aa  110  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  46.61 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  52.75 
 
 
144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  44.44 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  46.61 
 
 
148 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  52.75 
 
 
143 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  49.48 
 
 
141 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  42.14 
 
 
153 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  49.12 
 
 
144 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  43.97 
 
 
152 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  42.24 
 
 
152 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  46.39 
 
 
149 aa  98.2  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  38.66 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  43.04 
 
 
146 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  32.95 
 
 
173 aa  45.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  30.37 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  30.85 
 
 
221 aa  42  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>