105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_06461 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  100 
 
 
116 aa  237  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  93.97 
 
 
116 aa  223  6e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  92.24 
 
 
116 aa  222  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  92.24 
 
 
116 aa  222  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  79.13 
 
 
128 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  76.72 
 
 
119 aa  191  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  73.28 
 
 
116 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  73.28 
 
 
116 aa  184  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  73.04 
 
 
119 aa  183  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  70.69 
 
 
126 aa  178  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  58.93 
 
 
119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  58.93 
 
 
119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  60.18 
 
 
125 aa  143  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  50.39 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  51.4 
 
 
139 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  43.52 
 
 
139 aa  101  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  48.54 
 
 
104 aa  100  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0152  plastocyanin  42.4 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  40.52 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  34.58 
 
 
110 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  40.57 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  36.11 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  34.41 
 
 
173 aa  58.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  36.89 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  36.56 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  35.87 
 
 
224 aa  57.4  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  37.76 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  35.87 
 
 
210 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  32.74 
 
 
347 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  36.36 
 
 
807 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  36.28 
 
 
186 aa  54.7  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  36.89 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  32.99 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  35.63 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  36.36 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  31.88 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  32.1 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  35.77 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  40.3 
 
 
417 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  31.13 
 
 
137 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  32.46 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  32.97 
 
 
205 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  35.56 
 
 
212 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 
116 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  37.65 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  35.56 
 
 
209 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  32.14 
 
 
144 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  40.62 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  32.5 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  34.74 
 
 
292 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  39.39 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  31.65 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  34.83 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  34.31 
 
 
221 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  34.41 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  36.59 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  40.26 
 
 
318 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  35.87 
 
 
152 aa  47  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  31.25 
 
 
146 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  37.18 
 
 
120 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  30.38 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  30.77 
 
 
264 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  31.25 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  35.48 
 
 
358 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  30.38 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  32.14 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  31.15 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  58.06 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  34.69 
 
 
235 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  32.98 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  39.06 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  30.33 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  31 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  27.59 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  34.29 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  35.06 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  30.43 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  31.67 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  30 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  32.95 
 
 
336 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  32.56 
 
 
255 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  31.11 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  32.86 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  29.41 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  31.09 
 
 
272 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  30 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  36.71 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  30.12 
 
 
143 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  31.91 
 
 
110 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  28.1 
 
 
168 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  33.85 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  34.88 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  35.8 
 
 
231 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  35.63 
 
 
486 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  30.58 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  31.94 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  27.82 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4181  blue (type 1) copper domain protein  35.63 
 
 
334 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  33.72 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  32.14 
 
 
164 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>