33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1006 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  100 
 
 
152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  100 
 
 
152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  86.93 
 
 
163 aa  247  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  52.45 
 
 
173 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  50.35 
 
 
151 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  47.97 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  46.67 
 
 
187 aa  124  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  48.78 
 
 
146 aa  123  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  45.83 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  43.8 
 
 
168 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  43.8 
 
 
146 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  44.9 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  45.6 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  43.33 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  45 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  43.09 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  40.3 
 
 
152 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  42.34 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  42.5 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  45.16 
 
 
157 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  41.73 
 
 
148 aa  103  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  41.27 
 
 
146 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  36.5 
 
 
147 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  40.68 
 
 
144 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  37.04 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  41.91 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  44.68 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  39.84 
 
 
143 aa  87  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  44.76 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  38.1 
 
 
144 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  30.51 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  31.72 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  30.7 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>