41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2245 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  100 
 
 		 146 aa  289  7e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  65 
 
 		 146 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  59.35 
 
 		 187 aa  158  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  57.75 
 
 		 173 aa  156  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  55.48 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  51.05 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  59.17 
 
 		 150 aa  143  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  49.02 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  50.34 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  53.33 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  50.35 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  50 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  52.76 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  50.83 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  50.83 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  49.19 
 
 		 146 aa  123  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  48.39 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  47.97 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  47.97 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  57.89 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  48.36 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  47.06 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  45.07 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  45.07 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  42.86 
 
 		 161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  47.54 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  41.3 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  47.83 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  45.16 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  48.94 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  55.56 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  33.87 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  33.91 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  29.81 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  34.83 
 
 		 255 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  30.58 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  30.58 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  30.11 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  28.46 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  30.58 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  28.23 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>